根据《工伤保险条例》规定，员工确诊职业病后可按以下流程申请赔偿：
- 职业病诊断：在省级卫生部门批准的医疗机构进行诊断，取得《职业病诊断证明书》。
- 工伤认定：30日内向当地社保部门提交工伤认定申请，需提供劳动合同、诊断证明等材料。
- 劳动能力鉴定：伤情稳定后申请伤残等级鉴定，结果将决定赔偿标准。
- 赔偿项目：
- 医疗费、住院伙食补助费
- 停工留薪期工资（原工资福利不变）
- 一次性伤残补助金（7-27个月本人工资）
- 按月发放伤残津贴（1-6级伤残）
注意：未参保用人单位需自行承担全部赔偿，劳动者可向劳动仲裁委员会申诉。
