农村房屋产权纠纷应当怎么处理

农村房屋产权纠纷处理方式如下：

1. 协商调解：当事人可先通过村委会或乡镇司法所进行调解，达成书面协议。
2. 确权申请：向当地自然资源部门（原国土局）申请宅基地使用权及房屋所有权确权登记。
3. 行政诉讼：对政府确权决定不服的，可在60日内提起行政复议或6个月内向法院起诉。
4. 民事诉讼：涉及继承、买卖等纠纷的，可直接向法院提起确权或侵权诉讼。
5. 证据准备：需提供宅基地审批文件、建房证明、历史凭证等材料。

注：2016年后农村宅基地改革试点地区需额外注意流转限制政策。